色譜分析 - 氨基酸特點(diǎn)

氨基酸

特性

結(jié)構(gòu)

丙氨酸

Ala

A

類型：疏水性

精氨酸

Arg

R

類型：堿性
功能：精氨酸側(cè)鏈有三個(gè)緊密結(jié)合的氮原子，是一種堿性極強(qiáng)的氨基酸，pH高達(dá)12.5。
      精氨酸與天冬氨酸或谷氨酸形成靜電復(fù)合物（鹽橋），強(qiáng)化蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)。
      它還與附著在蛋白質(zhì)的酸性基團(tuán)相互作用，例如核酸的磷酸基團(tuán)。

天冬酰胺

Asn

N

類型：弱極性
功能：天冬酰胺是脫酰胺的主要位置，也是甘氨酸（低聚糖）的結(jié)合點(diǎn)。

天冬氨酸

Asp

D

類型：酸性

功能：天冬氨酸的pH為4，與堿性氨基酸相互作用形成靜電復(fù)合物（鹽橋）。
      天冬氨酸還是金屬離子等帶正電荷基團(tuán)的結(jié)合位點(diǎn)，其功能的發(fā)揮在多種蛋白質(zhì)中很重要。

半胱氨酸

Cys

C

類型：弱極性（含硫）

功能：半胱氨酸在蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)中具有重要作用，其與其它半胱氨酸側(cè)鏈發(fā)生反應(yīng)并在多肽鏈的不同部分形成共價(jià)鍵（二硫鍵）。

谷氨酰胺

Gln

Q

類型：弱極性

功能：谷氨酰胺的脫酰胺作用與天冬酰胺相比較難，因此基本不作為脫酰胺位點(diǎn)。

谷氨酸

Glu

E

類型：酸性

功能：谷氨酸的pH稍高于4，與堿性氨基酸相互作用形成靜電復(fù)合物（鹽橋）。
      谷氨酸還是金屬離子等帶正電荷基團(tuán)的結(jié)合位點(diǎn)，其功能的發(fā)揮在多種蛋白質(zhì)中很重要。

甘氨酸

Gly

G

類型：中性
功能：甘氨酸非常小，側(cè)鏈僅有一個(gè)氫，它作為中性氨基酸在肽鏈中延伸。

組氨酸

His

H

類型：堿性
功能：組氨酸側(cè)鏈為弱堿性，pH在6~7之間。組氨酸能夠與酸結(jié)合，但取決于環(huán)境pH。

異亮氨酸

Ile

I

類型：疏水性
功能：與其它疏水性氨基酸一樣，異亮氨酸殘基協(xié)助形成并維持蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)。

亮氨酸

Leu

L

類型：疏水性
功能：與其它疏水性氨基酸一樣，亮氨酸協(xié)助形成并維持蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)。

賴氨酸

Lys

K

類型：堿性
功能：賴氨酸側(cè)鏈?zhǔn)遣奉悾?/span>pH為~10.5。
      賴氨酸與天冬氨酸或谷氨酸形成靜電復(fù)合物（鹽橋），強(qiáng)化蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)。
      它還與附著在蛋白質(zhì)的酸性基團(tuán)相互作用，例如核酸的磷酸基團(tuán)。

甲硫氨酸

Met

M

類型：弱疏水性（含硫）

功能：甲硫氨酸是最可能被氧化的氨基酸。它是發(fā)生氧化作用的指示劑。甲硫氨酸氧化還可能影響生物活性。

苯丙氨酸

Phe

F

類型：疏水性、芳香性
功能：與其它疏水性氨基酸一樣，苯丙氨酸協(xié)助形成并維持蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)。
       由于具有芳香性，苯丙氨酸還是紫外光吸收的有效檢測(cè)目標(biāo)。

脯氨酸

Pro

P

類型：弱疏水性
功能：脯氨酸是一種獨(dú)特的氨基酸，其疏水側(cè)鏈與氨基酸末端連接，在肽鏈中產(chǎn)生張力，使肽鏈彎曲。
      該結(jié)構(gòu)特征協(xié)助形成蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)。

絲氨酸

Ser

S

類型：極性（含羥基)
功能：絲氨酸通過(guò)氫鍵與其它氨基酸殘基或部分蛋白質(zhì)結(jié)合。還能通過(guò)氫鍵與其它蛋白質(zhì)或基團(tuán)結(jié)合。
      絲氨酸還是細(xì)胞蛋白質(zhì)磷酸化的位點(diǎn)。

蘇氨酸

Thr

T

類型：極性（含羥基)

功能：蘇氨酸通過(guò)氫鍵與其它氨基酸殘基或部分蛋白質(zhì)結(jié)合。還能通過(guò)氫鍵與其它蛋白質(zhì)或基團(tuán)結(jié)合。
       蘇氨酸還是細(xì)胞蛋白質(zhì)磷酸化的位點(diǎn)。

酪氨酸

Tyr

Y

類型：極性（含羥基）、芳香性

功能：酪氨酸通過(guò)氫鍵與其它氨基酸殘基或部分蛋白質(zhì)結(jié)合。還能通過(guò)氫鍵與其它蛋白質(zhì)或基團(tuán)結(jié)合。
      酪氨酸還是細(xì)胞蛋白質(zhì)磷酸化的位點(diǎn)。酪氨酸具有芳香性，提供紫外吸收位點(diǎn)。

色氨酸

Trp

W

類型：疏水性、芳香性
功能：色氨酸具備多環(huán)結(jié)構(gòu)，能夠通過(guò)氫鍵延長(zhǎng)。由于具備芳香性，色氨酸提供紫外光吸收位點(diǎn)。
       色氨酸還能發(fā)出微弱的天然熒光。

纈氨酸

Val

V

類型：疏水性
功能：纈氨酸側(cè)鏈?zhǔn)且粋€(gè)疏水性異丙基。
      與其它疏水性氨基酸一樣，纈氨酸協(xié)助形成并維持蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)。